Основной фонд составляет более 2000 единиц и насчитывает 14 коллекций. Это документальные материалы, фотоматериалы, предметы археологии, живопись, предметы истории и техники.

В краеведческом музее работает 5 залов:

- Зал наземной природы;

- Зал вулканов;

- Зал морской природы;

- Зал древней истории;

- Зал современной истории;

- Выставочный зал.

В залах представлены географическая и климатическая карты Сахалинской области, геологический макет о. Кунашир, гербарные образцы растений, чучела и фотографии птиц и зверей, образцы горных пород, стенды по вулканам, керамика и орудия труда древних жителей, экспозиции, посвященные айнам и истории освоения Курильских островов фотографии и экспонаты, рассказывающие о военных действиях 1945 г. и послевоенной истории островов.

Музей является информационным ресурсом для жителей и гостей района, его "визитной карточкой". Музей проводит не только исследования, коллекционирование, хранение природных и исторических материалов, но и организацию временных выставок, выставок вне музея, организует экскурсии, лекции, музейные уроки, мастер-классы, презентации книг, просмотр видеофильмов, связанных с историей открытия, освоения и развития Южных Курил, просмотр тематических видеопрезентаций.